Anthony Kiedis wurde am 1. November 1962 in Grand Rapids, Michigan, als Sohn von John Kiedis (Künstlername: Blackie Dammet) und Margaret “Peggy” Idema geboren. Seine Eltern ließen sich im Jahre 1968 scheiden.
Kiedis lebte bis zu seinem 11. Lebensjahr zusammen mit seiner Mutter in Grand Rapids, bevor er zu seinem Vater nach Los Angeles, Kalifornien zog.

Kiedis hat eine lange Drogenkarriere hinter sich; sein Vater führte ihn als Teenager in die Drogenszene ein. Seinen ersten Joint rauchte er mit 12 Jahren mit seinem Vater zusammen. Er führte auch schon als Kind ein sehr exzesives Sexleben, da er im Alter von 13 Jahren das erste Mal Sex mit der damaligen Freundin seines Vaters hatte. Blacky war immer sein großes Vorbild, er wollte sein wie er. Deshalb ließ sich Thony all die Anzüge seines Vaters maßanschneidern und schauspielerte auch ein wenig in Filmen, jedoch stets nur kleine Rollen. Flea lernte er in der High School kennen und sie waren stets beste Freunde, sie erlebten viel zusammen, Hillel kam erst an der High School dazu, sie waren ein unzertrennliches Trio. Mit Jack Irons zusammen gründeten sie die Red Hot Chili Peppers. Er lebte ein absolutes Sex Drugs and Rock ‘n’ Roll Leben. Nach Hillel Slovaks Tod, wollte er mit seinem Drogenleben aufhören, wurde jedoch rückfällig, danach war er wieder für ca. 5 Jahre clean, doch durch die Schuld eines Zahnarztes, der ihm beim Ziehen eines Zahnes Valium spritzte, wurde er erneuert rückfällig. Mittlerweile ist er, wie auch John und Flea, clean. Die Drei führen nun ein drogenfreies Leben und sind Vegetarier geworden. Seine Autobiographie Scar Tissue wurde 2004 in den USA und Großbritannien veröffentlicht. Die deutsche Übersetzung ist im Juni 2005 erschienen.