Autechre gehören wahrscheinlich zu den umstrittensten Künstlern im Electro-Zirkus. Von den Einen als unhörbare, nur Lärm produzierende Frickler gebrandmarkt, werden sie von Anderen als musikalische Visionäre gepriesen. Den Anfang nimmt die Geschichte von Autechre in Rochdale im Großraum Manchester, als sich Rob Brown und Sean Booth 1987 durch ihre Aktivität in der Graffiti-Szene treffen. Beeinflusst von Techno und Hip-Hop beginnen sie, untereinander Mixtapes zu tauschen und arbeiten bald an eigenen Kompositionen, die sie mit billigem Equipment zusammenbasteln. Unter dem Namen Lego Feet veröffentlicht das Duo seine erste 12-Inch beim Label Skam Records. Die erste Veröffentlichung unter dem Namen Autechre wird die Single „Cavity Job“ 1991 bei Hardcore Records. Ein Jahr später erscheinen zwei Autechre-Tracks auf der Warp-Compilation „Artificial Intelligence“.

Wie alle folgenden Releases kommt das Debütalbum von Brown und Booth, „Incunabula“, 1993 auch bei Warp heraus. Es wird ein Überraschungserfolg und geht auf Platz eins der UK-Indie-Charts. Es ist noch klar im Techno verwurzelt, zeigt aber schon die rhythmischen Schnörkel und Percussionpatterns, die später charakteristisch für ihr Werk werden. Ein Jahr später folgt bereits der Zweitling „Amber“. Das dritte Album „Tri Repetae“ wird 1995 veröffentlicht, sowie die EPs „Anvil Vapre“ und „Garbage“, die alle zusammen als Klassiker der Mittneunziger Electromusik gelten. Der bekannte Clipregisseur Chris Cunningham dreht für den Song „Second Bad Vilbel“ sein erstes Video.

1997 erscheinen drei Platten von Autechre: das Album „Chiastic Slide“ und die EPs „Enyane“ und „Cichlisuite“. Mit einem unbetitelten Album (auch „LP5“ oder „Autechre“ genannt) wendet sich das Duo 1998 immer mehr einem experimentellen Sound zu. Ein Jahr später erscheint ihre erste Peel-Session-EP. Nach der 1999er „EP7“ sieht das neue Jahrhundert einen drastischen Stilwechsel von Brown und Booth. „Confield“ (2001), „Gantz Graf“ (2002) und „Draft 7.30“ (2003) sind von zügellosen Rhythmen und kargen Melodien geprägt. Die Reaktionen von Kritikern und Fans auf den Wechsel sind gemischt, aber in der Mehrheit positiv. Das achte Album Autechres, „Untilted“, erscheint 2005, gefolgt von einer zweimonatigen Tour durch Europa, Amerika und Japan. Nach einer ungewöhnlich langen Pause kommt „Quaristice“ Anfang 2008 heraus. Im März 2010 erscheint das zehnte Album des Duos, „Oversteps“, gefolgt von einer zweimonatigen Europa-Tournee.